Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms