Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms