Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L3A6NEY3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms