Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALM3A6NDB9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms