Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms