Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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