Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC009403.2-202ENST00000636307 3956 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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