Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD10P28358 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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