Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF556-201ENST00000307635 6574 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB6-202ENST00000616430 4601 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EDNRA-201ENST00000324300 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP12A-202ENST00000381946 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A3-201ENST00000270349 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A11-AS1-202ENST00000510767 4654 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR100HG-212ENST00000531381 3370 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-207ENST00000542733 2287 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDST2-207ENST00000639645 2448 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RASAL1-204ENST00000546530 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN2-212ENST00000638378 4447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SMLR1-201ENST00000541421 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED1-203ENST00000375722 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM62-201ENST00000291416 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A8-201ENST00000393469 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKB-202ENST00000416505 4036 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC3-201ENST00000359440 4641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL1-201ENST00000276935 2906 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGC3-201ENST00000308177 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP4K2C-201ENST00000354947 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR497-201ENST00000385056 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS18BP1-201ENST00000414228 192 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL117328.1-201ENST00000422315 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTG1P12-201ENST00000423183 1166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB4BP3-201ENST00000437546 271 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms