Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIF3AQ9Y496 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms