Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms