Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRQQ9UMZ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRQQ9UMZ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms