Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms