Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHIC2Q9UKJ5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms