Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEFF2Q9UIK5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms