Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFA12Q9UI09 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms