Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACFD1Q9UGQ2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms