Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DBF4Q9UBU7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms