Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms