Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPASTQ9UBP0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms