Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms