Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4AQ9P2Q2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms