Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms