Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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