Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms