Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLCO1C1Q9NYB5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms