Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL28Q9NXS3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms