Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A12Q9NXJ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A12Q9NXJ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms