Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THUMPD1Q9NXG2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THUMPD1Q9NXG2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms