Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMILIN3Q9NT22 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms