Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms