Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms