Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTBP3Q9NS15 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP3Q9NS15 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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