Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNNM1Q9NRU3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms