Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO4Q9NRQ5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMCO4Q9NRQ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms