Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms