Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms