Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD3Q9H7E2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms