Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC8Q9H0W5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms