Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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