Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms