Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL3Q9BXA9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms