Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA7Q9BWT1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms