Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAGR1Q9BTK6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms