Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms