Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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