Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SORCS2Q96PQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms