Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC41A2Q96JW4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms