Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms