Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms